Siden introduksjonen på 1970-tallet har mikrobiell analyse gjennomgått kontinuerlig utvikling og forbedring. Opprinnelig ble mikrobiell analyse hovedsakelig brukt til påvisning av miljøprøver, og senere gradvis utvidet til feltene medisin, landbruk, bioingeniør, etc. Med den kontinuerlige utviklingen av bioteknologi har mikrobiell analyse også blitt kontinuerlig innovert og forbedret, og blitt en viktig analytisk metode.
